一个细胞中含有多少DNA

作者:新景实验室
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选用“一个细胞含有多少DNA作为题目时,小编纠结了好久,因为这个问题问得实在不够专业,不同生物细胞中的DNA含量是由其基因组DNA的长度决定的--更糟糕的是,病毒没有细胞结构,还不能作为“细胞”囊括进去。因此最精确的问题应当是:“构成一个生物样本的最小单元含有多少核酸”,但是这个题目的吸引力肯定会大打折扣。退而求次,毕竟选择提问“一个细胞含有多少DNA”的同学,更可能会问“试剂盒一次能提多少DNA”。

针对“试剂盒一次能提多少DNA”这个问题,其实进一步的需要思考的是“生物样本中含有多少DNA”,然后我们自然开始追问,构成样本的每个最小的单元(细胞,细菌或病毒)含有多少DNA

我们以人类为例来计算一个人类细胞中含有多少DNA

从百度搜索可知以下数据:

1. 人类基因组DNA约为3×109 bp,且为二倍体基因组,故一个人类细胞中含有6×109 bp的基因组DNA

2. 已知1.5pmol1000bpDNA分子质量1μg

3. 1g=1000mg=106μg=109ng=1012pg

4. 1mol=1000mmol=106μmol=109nmol=1012pmol,则1.5pmol=1.5×10-12mol

那么可计算得

1.5pmol=1.5×10-12×6.02×1023=9.03×1011

    1000bp×9.03×1011=1bp×9.03×1014=1μg

    1个人类细胞所含的DNA质量为:

6×109bp/9.03×1014=6.64×10-6μg

至此,计算公式可以简化为:

某物种单个细胞(或结构单元)的DNA含量=(某物种基因组DNA碱基数×倍体数/9.03×1014μg

反过来:

提取1μg 某物种的DNA所需要的细胞数量= 9.03×1014/(某物种基因组DNA碱基数×倍体数),那么要从人类培养细胞中提取到1μg DNA,至少需要1.51×105细胞。

注意:

1. 真核生物实际所需的细胞数可能会比算出来的少一些,因为真核细胞中的线粒体、叶绿体也能贡献DNA。当然,由于提取效率不可能达到100%,算出来所需的细胞数还是差不多的。

2. 有的生物只有一套基因组,为一倍体,如细菌等;有的含两套多套基因组,为二倍体,如人类;还有的含有多套基因组,为多倍体,如四倍体水稻、三倍体水稻等。

 

算到这儿,小编决定隆重推出simgen常数:simgen=9.03×1014,同学们只要牢记simgen常数9.03×1014,算起来好轻松哦。

让我们一起看下用simgen常数算出来的,获得不同物种1μg DNA需要多少个细胞/病毒数吧:

物种名称

基因组大小(bp

倍体数

个细胞(病毒数)/μg DNA

3,000,000,000

2

1.51×105

小鼠

2,716,965,481

2

1.66×105

大鼠

2,800,000,000

2

1.62×105

2,389,078,169

2

1.89×105

大肠杆菌

4,000,000

1

2.25×108

酵母

20,000,000

1

4.52×107

λ 噬菌体

50,000

1

1.81×1010

乙肝病毒

3,200

1

2.82×1011

水稻

466,000,000

2

9.7×105

N

1.94×106/N

玉米

2,500,000,000

2

1.81×105

N

3.61×105/N

斑马鱼

1,700,000,000

2

2.66×105

河豚

500,000,000

2

9.10×105

当我们可以预判样本中的DNA含量时,就可以更科学选择合适的DNA提取方法了:

1. 当样本中的DNA含量大于50 μg 以上时,通常小量制备的核酸纯化柱已经超载了(比如产生堵柱子的现象),应选用中大量DNA提取试剂盒,或者是选用经典的酚氯仿抽提,异丙醇沉淀DNA

2. 当样本中的DNA含量介于1-30 μg时,推荐选用试剂盒提取DNA。用酚氯仿抽提,异丙醇沉淀法可能会观察不到DNA沉淀;

3. 当样本中的DNA含量小于1 μg时,酚氯仿抽提,异丙醇沉淀法几乎失效,挽救的方法是添加Carrier RNASimgenCat.4003101)或是糖元协助DNA共同沉淀;更简单的方案是购买Simgen 微量DNA提取试剂盒(Cat.3102050);

4. 当样本中的DNA含量小于1ng时,请先按方案3尝试;如果还不行,请拨打400-0099-857获取帮助吧。

 

 新景生物实验室

                                                          20161123